Os departamentos curriculares constituem a estrutura de orientação educativa a quem incumbe, fundamentalmente, o desenvolvimento de medidas que reforcem a articulação curricular e interdisciplinar na aplicação dos planos de estudo e na implementação das estratégias estabelecidas no projeto educativo.
Têm como funções principais apresentar propostas para o Projeto Educativo da Escola e Plano Anual de Atividades, elaborar pareceres sobre programas, métodos e organização curricular, processos e critérios de avaliação, apoios e complementos educativos, planificar atividades letivas e não letivas, promover a interdisciplinaridade e inventariar as necessidades em equipamento e material didático.
Os departamentos do Agrupamento de Escolas de Castro Marim e respetivos coordenadores são:
| Departamento | Coordenador(a) |
| Departamento de Matemática e Ciências Experimentais | Prof.ª Celisia Santos |
| Departamento de Línguas | Prof.ª Cristina Felício |
| Departamento de Expressões | Prof.ª Cristina Serote |
| Departamento de Ciências Sociais e Humanas | Prof.ª Graça Corvinho |
| Departamento de Educação Especial | Prof.ª Anabela Martins |
| Departamento do 1.º ciclo | Prof.ª Anabela Madeira |
| Departamento do Pré-escolar | Educ.ª Florbela Cavaleiro |